个人简介

        Williamhill中文教授，博士生导师。2005年毕业于武汉大学生命科学学院获得理学学士学位。2010年毕业于中国科学院昆明动物研究所获得遗传学博士学位（师从宿兵研究员）。2010年至2016年分别在美国爱荷华大学（2010~2012）和加州大学洛杉矶分校（2013~2016）邢毅教授实验室从事生物信息学方向博士后研究。2016年获聘william威廉英国引进人才。2018年入选广东省珠江人才计划“青年拔尖人才”。       
       实验室成立以来已经以通讯作者身份在Molecular Cell （2篇）、Nature Chemical Biology、Nature Communications （2篇）, Nucleic Acids Research（2篇）、Genome Biology等杂志发表论文13篇，除两篇综述论文外，其余11篇论文IF>10。

       实验室主要研究兴趣是利用第二代以及第三代高通量测序技术结合生物信息学、基因组学和分子生物学的方法开发m6A修饰的检测技术和算法、研究m6A RNA修饰的调控模式和机理，及其在干细胞、肿瘤等重大生理病理过程中的作用。实验室采用“干湿结合”的方式开展研究，通过算法开发、实验技术和组学技术开发从新的维度解析RNA修饰的模式，从新的角度提出前沿科学问题，并通过严谨的生化实验和组学分析深入阐明科学问题。

学术成果

      m6A RNA修饰是mRNA上最普遍的内源性修饰，在发育、免疫、肿瘤发生等多种生理或者病理过程中发挥重要作用。为了响应外界环境刺激并维持细胞内环境的稳态，m6A修饰展现出高度的选择性和时空特异性。然而，由于m6A功能广泛，整体干预m6A的策略在临床转化中面临困境，而选择性干预m6A的策略非常匮乏，主要原因是m6A的选择性调控机制尚不明确。

      实验室围绕“m6A如何选择性地标记不同的RNA特异性调控干细胞、肿瘤等重大生理病理过程”这一核心科学问题开展了一系列工作，主要成绩包括：

（1）针对m6A如何选择性地标记不同染色质区域的RNA，揭示了p300由于主要在H3K27ac的染色质上乙酰化METTL3，从而选择性地调控H3K27ac关联的染色质RNA的 m6A修饰，并介导PAK2激酶对肿瘤细胞铁死亡逃逸的促进作用。阐明了一种通过不同蛋白在细胞内亚空间上共同发生翻译后修饰介导m6A选择性调控的新型调控模式（Molecular Cell 2025a, 唯一通讯; Nature Chemical Biology 2025，共同通讯；Molecular Therapy 2024, 唯一通讯）。

（2）针对m6A如何选择性地标记相同基因的不同RNA异构体，通过建立在纳米孔直接RNA测序的单分子水平检测m6A修饰的深度学习模型，发现不同异构体在相同m6A位点也能形成差异的m6A修饰。在上皮-间质转化（EMT）中，激活的转录因子通过选择性促进同一基因中特定启动子驱动的RNA异构体的m6A修饰，实现对不同启动子来源RNA异构体的精细调控。揭示了一种全新的m6A修饰调控层次，开辟了异构体的表观转录组学新领域（Molecular Cell 2025b, 唯一通讯；Genome Biology 2021, 唯一通讯；Nature  Communications 2025，共同通讯）。
（3）针对m6A如何建立细胞特异性修饰模式，揭示大量细胞特异性表达的RNA结合蛋白（RBP）参与建立细胞特异性m6A模式。开发基于单碱基编辑的m6A位点功能筛选技术，发现在胚胎干细胞分化中不同m6A位点促进不同的分化方向。为理解m6A修饰的细胞特异性奠定了理论基础（Nature Communications 2022, 最后通讯；Nucleic Acids Research 2020, 唯一通讯; Genomics Proteomics and Bioinformatics 2023, 共同通讯）。

 

近5年发表的学术论文

 * 共同第一作者； # 通讯作者  本课题组成员或客座人员加粗显示

  1. Ren Z*, He J*, Huang X*, Gao Y*, Wei C*, Wu Z, Guo W, Wang F, Zhang Q, Sun X, Zhang J, Cao N, LinL#, Wang J#, Cun Y#(2025). Isoform characterization of m6A in single cells identifies its role in RNA surveillance. Nature Communications 16;5828 （IF=15.7）
  2. Huang C*, Shu X*, Zhou S*, Mi Y, Bian H, LiT, LiT, YingX, ChengC, LiuD, Gao M, WenY, Ma Q, WangF, Cao J#, Wang J#, Liu J# (2025). Nuclear m6A modification regulates satellite transcription and chromosome segregation. Nature Chemical Biology. (BioArt 报道) (IF=13.7)
  3. Huang X*, Zhang J*, Cun Y*, Ye M*, Ren Z*, Guo W, Ma X, Liu J, Luo W, Sun X, Shao J, Wu Z, Zhu X, Wang J# (2025). Spatial control of m6A deposition on enhancer and promoter RNAs through co-acetylation of METTL3 and H3K27 on chromatin.Molecular Cell 85(7):1349-1365.e10.（BioArt 报道, Featured Article, Previewed by Dr. Chuan He.）. （IF=16.6）
  4. Guo W*, Ren Z*, Huang X*, Liu J, Shao J, Ma X, Wei C, Cun Y, He J, Zhang J, Wu Z, Guo Y, Zhang Z, Feng Z, He J, Wang J#(2025). Single-molecule m6A detection empowered by endogenous labeling unveils complexities across RNA isoforms. Molecular Cell 85(6):1233-1246.e7（BioArt 报道）. (IF=16.6）
  5. Cun Y, Guo W, Ma B, Okuno Y, and Wang J# (2024). Decoding the specificity of m6A RNA methylation and its implication in cancer therapy. Molecular Therapy 32(8):2461-2469. （Invited review). （IF=12.0）
  6. Yu P*, Zhou S*, Gao Y, Liang Y, Guo W, Wang DO, Ding S, Lin S#, Wang J#, Cun Y# (2023), Dynamic Landscapes of tRNA Transcriptomes and Translatomes in Diverse Mouse Tissues.Genomics, Proteomics & Bioinformatics21(4):834-849 (IF=11.5)
  7. Sun X#, Wang DO, Wang J# (2022). Targeted manipulation of m6A RNA modification through CRISPR-Cas-based strategies. Methods203:56-61（Invited review).
  8. Cheng W*, Liu F*, Ren Z, Chen W, Chen Y, Liu T, Ma Y, Cao N #, Wang J # (2022), Parallel functional assessment of m6A sites in human endodermal differentiation with base editor screens, Nature Communications 13:478 (IF=17.7) (BioArt 报道)
  9. Cun Y*, An S*, Zheng H*, Lan J, Chen W, Luo W, Yao C, Li X, Huang X, Sun X, Wu Z, Hu Y, Li Z, Zhang S, Wu G, Yang M, Tang M, Yu R, Liao X, Gao G, Zhao W, Wang J#, Li J# (2023), Specific Regulation of m6A by SRSF7 Promotes the Progression of Glioblastoma. Genomics, Proteomics & Bioinformatics 21(4):834-849.(IF=11.5) 
  10. Tan L*, Cheng W *, Liu F, Wang DO, Wu L, Cao N, Wang J # (2021) Positive natural selection of N6-methyladenosine on the RNAs of processed pseudogenes. Genome Biology, 22:180. (IF=17.9) （BioArt 报道）
  11. Wang J (2021). Integrative analyses of transcriptome data reveal the mechanisms of post-transcriptional regulation. Briefings in Functional Genomics elab004 (Invited review)
  12. Xia TL, Li X, Wang X, Zhu YJ, Zhang H, Cheng W, Chen ML, Ye Y, Li Y, Zhang A, Dai DL, Zhu QY, Yuan L, Zheng J, Huang H, Chen SQ, Xiao ZW, Wang HB, Roy G, Zhong Q, Lin D, Zeng YX, Wang J, Zhao B, Gewurz BE, Chen J, Zuo Z, and Zeng MS (2021). N(6)-methyladenosine-binding protein YTHDF1 suppresses EBV replication and promotes EBV RNA decay. EMBO Reports e50128.